Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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