Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms