Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L6Q3SYB3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L6Q3SYB3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms