Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms