Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MICAQ29983 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MICAQ29983 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms