Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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