Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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