Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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