Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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HIF1AQ16665 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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