Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms