Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP7Q16576 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms