Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms