Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN9AQ15858 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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