Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms