Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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