Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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