Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPAQ15257 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms