Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms