Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
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