Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms