Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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