Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC10A1Q14973 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC10A1Q14973 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms