Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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