Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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