Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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