Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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