Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
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