Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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NR1H3Q13133 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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NR1H3Q13133 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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