Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms