Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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