Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCP2Q13094 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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