Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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