Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms