Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD300CQ08708 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD300CQ08708 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD300CQ08708 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD300CQ08708 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD300CQ08708 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD300CQ08708 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD300CQ08708 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD300CQ08708 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms