Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms