Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FMODQ06828 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms