Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBQ06643 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBQ06643 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBQ06643 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms