Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARID5AQ03989 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms