Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms