Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms