Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms