Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms