Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms