Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms