Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms