Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMF1P82094 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMF1P82094 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms