Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms