Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms