Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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