Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTBP60709 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ACTBP60709 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTBP60709 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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